2023年11月14日 ，美國國家科學院院士 、哥倫比亞大學的Wayne A. Hendrickson教授應研究所邀請做客"貝時璋講座" ，並作題為"AlphaFold in Analyzing Protein Crystal Structures"的學術報告 ，吸引了所內大量科研人員與學生參會 。本次講座由孫飛研究員主持 。

　　Hendrickson教授是國際著名的蛋白質晶體學家 ，曾獲得瑞典皇家科學院愛明諾夫獎 、加拿大蓋爾德納國際獎 、以色列理工學院哈維獎等多項國際學術獎項 。他在蛋白質晶體學的方法學發展方面做出了傑出的貢獻 ，先後在Science 、Nature 、Cell 、PNAS 、EMBO J 、J Mol Biol 、Structure 、Nat Struct Mol Biol等國際頂尖的學術期刊上發表學術論文近600篇 。尤其是他提出並創立的多波長異常色散法（MAD法）得到了廣泛的應用 ，為結構生物學的發展提供了強有力的技術支撐 。他的研究團隊還解析了許多重要的蛋白質結構 ，如CD4 、CD8 、胰島素受體激酶 、Hsp70 、SRC激酶 、HIV gp120 、鈣黏蛋白 、FGF等 ，為理解人類疾病的分子機制和藥物開發提供了重要的信息 。

　　在報告中 ，Hendrickson教授首先介紹了蛋白質晶體學的背景 ，並講解了在解析蛋白質晶體結構中確定晶體相位的幾種方法 ，包括Multiple Isomorphous Replacement(MIR) 、Single Isomorphous Replacement(SIR) 、Single-wavelength Anomalous Diffraction (SAD)等 ，以及對晶體結構進行密度修正的原理和應用 。隨後 ，Hendrickson教授展示了結構預測算法Alphafold的基本原理 、技術特點以及發展趨勢 ，講解了Alphafold對解析蛋白質晶體學的影響 ，並展示了幾種藉助AlphaFold來解析蛋白質晶體結構的方法 。Hendrickson教授證明AlphaFold可以有效的對分子置換進行輔助（AlphaFold-guided MR） ，並開發了一種自動化計算該流程的軟件 。針對低分辨的晶體結構 ，Hendrickson教授基於AlphaFold和Rosetta軟件提出了Quasi-rigid-body AlphaFold/Rosetta-assisted Low-resolution Structure (QARLS Refinement)的方法 ，能夠搭建和修正更為準確的晶體結構 ，並在RyR1等蛋白晶體結構的例子中展示了該方法的有效性 。

　　最後 ，Hendrickson教授總結並展望了Alphafold對結構生物學的影響 。他認為AlphaFold在蛋白質結構預測方面非常成功 ，其訓練數據主要來自於PDB數據庫中大量已解析的蛋白質晶體結構 ，而且大多數晶體結構都是基於MAD和SAD方法解析得到的 。人們可以利用AlphaFold輔助的分子置換方法確定新的晶體結構 ，並利用"QARLS"方法輔助低解像度下的晶體結構修正 。此外 ，AlphaFold也一定程度上促進了冷凍電鏡結構研究技術的發展 。然而 ，儘管AlphaFold在預測蛋白質結構方面取得了顯著的成就 ，Hendrickson教授認為實驗數據對於了解新的蛋白結構仍然是必不可少的 。

　　報告結束後 ，Hendrickson教授與在場的聽眾進行了熱烈的討論和交流 ，回答了大家提出的各種問題 。報告會取得了圓滿成功 ，為老師和同學們提供了一次難得的學習和交流的機會 。

Wayne A. Hendrickson教授作報告

孫飛研究員主持報告

合影留念

報告現場

（供稿 ：孫飛研究組；核稿 ：科技處）